MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE03

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016821	T	6	6	98	103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016821	GT	3	6	133	138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016821	TGC	2	6	177	182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016821	GAT	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016821	AGC	2	6	221	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016821	ATGT	2	8	262	269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016821	ATA	2	6	372	377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016821	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016821	A	6	6	483	488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016821	CTGG	2	8	549	556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016821	CTGG	2	8	639	646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016821	AGCT	2	8	754	761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016821	C	6	6	766	771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_016821	GGT	2	6	810	815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016821	AAC	2	6	842	847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016821	ATT	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016821	TCC	2	6	879	884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016821	CATAG	2	10	899	908	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016821	AAT	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016821	T	7	7	1009	1015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016821	AAT	2	6	1061	1066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016821	GAT	2	6	1070	1075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016821	TCATTA	2	12	1095	1106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016821	TAT	2	6	1107	1112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016821	TAA	2	6	1118	1123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016821	A	7	7	1152	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016821	TTC	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016821	CGTT	2	8	1255	1262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016821	A	7	7	1283	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016821	TCA	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016821	TAAAT	2	10	1308	1317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016821	GTT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016821	T	6	6	1353	1358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016821	A	7	7	1385	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016821	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016821	T	7	7	2900	2906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016821	AAT	2	6	2912	2917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016821	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016821	T	7	7	2981	2987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016821	AT	3	6	3009	3014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016821	GTT	2	6	3118	3123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016821	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016821	TA	3	6	3481	3486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016821	TGT	2	6	3503	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016821	AGT	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016821	TA	3	6	3606	3611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016821	ATA	2	6	3769	3774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016821	TAA	2	6	3786	3791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016821	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016821	TGA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016821	AACT	2	8	3887	3894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016821	ATTAT	2	10	3903	3912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016821	T	6	6	4019	4024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016821	CTA	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016821	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016821	GATT	2	8	4427	4434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016821	ATA	3	9	4438	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016821	TGT	2	6	4465	4470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016821	CG	3	6	4487	4492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016821	TGG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016821	GA	3	6	4518	4523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016821	GTT	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016821	TATAT	2	10	5967	5976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016821	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016821	GAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016821	TTC	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016821	TAT	2	6	6520	6525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016821	TAC	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016821	T	6	6	6573	6578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016821	AC	3	6	6611	6616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016821	TAA	2	6	6693	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016821	AAACA	2	10	6699	6708	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016821	AACAA	2	10	6714	6723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016821	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016821	ATG	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016821	TTA	2	6	6820	6825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016821	TGA	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016821	T	6	6	6861	6866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016821	CCT	2	6	8162	8167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016821	CGA	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016821	CGG	2	6	8351	8356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016821	CG	3	6	8429	8434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016821	AAT	2	6	8466	8471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016821	TAA	2	6	8489	8494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016821	A	7	7	8496	8502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016821	CAAA	2	8	8546	8553	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016821	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016821	CCT	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016821	TAG	2	6	8714	8719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016821	ACA	2	6	8723	8728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016821	GAA	2	6	8787	8792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016821	CT	3	6	8809	8814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016821	T	8	8	8861	8868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016821	CTG	2	6	8934	8939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016821	TGG	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016821	ATG	2	6	9010	9015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016821	A	6	6	9051	9056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016821	G	6	6	9083	9088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016821	A	6	6	9099	9104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016821	AAC	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016821	ATA	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016821	TAA	2	6	9179	9184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016821	ATG	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016821	T	6	6	9222	9227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016821	TA	3	6	9230	9235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016821	AGG	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016821	ATT	2	6	9620	9625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016821	TATT	2	8	9672	9679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016821	TTTAG	2	10	9695	9704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016821	TGTT	2	8	9718	9725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016821	TCC	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016821	TAT	2	6	10464	10469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016821	TTTA	2	8	10475	10482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016821	CTT	2	6	10532	10537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016821	CTTC	2	8	10548	10555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016821	A	7	7	10559	10565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016821	ATT	2	6	10605	10610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016821	AT	4	8	10622	10629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016821	TA	3	6	10639	10644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016821	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016821	TAA	2	6	10721	10726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016821	ATTG	2	8	10736	10743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016821	TAT	2	6	10754	10759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016821	A	7	7	10765	10771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016821	A	7	7	10835	10841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016821	T	6	6	13071	13076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016821	ATT	2	6	13095	13100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016821	ATG	2	6	13151	13156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016821	AAAGA	2	10	13191	13200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016821	ATA	2	6	14118	14123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016821	ATT	2	6	14144	14149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016821	TTTA	2	8	14755	14762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016821	A	6	6	14807	14812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016821	ATG	2	6	16142	16147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016821	TCA	2	6	16200	16205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016821	GCA	2	6	18666	18671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016821	TCC	2	6	19139	19144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016821	TTA	2	6	19186	19191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016821	AAT	2	6	19210	19215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016821	CATTA	2	10	19239	19248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016821	A	7	7	19248	19254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016821	ATA	2	6	19262	19267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016821	CTG	2	6	19367	19372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016821	GAG	2	6	19401	19406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016821	AAG	2	6	19714	19719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016821	TA	3	6	19730	19735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016821	ATAA	2	8	19739	19746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016821	ACC	2	6	19846	19851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_016821	AATT	2	8	19907	19914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016821	TGG	2	6	19926	19931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016821	TTTG	2	8	19979	19986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016821	GAA	2	6	20020	20025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016821	TTA	3	9	20026	20034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016821	CAG	2	6	20071	20076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016821	TCT	2	6	20101	20106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_016821	AAAC	2	8	20174	20181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_016821	TGA	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016821	TGA	2	6	20222	20227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016821	CAA	2	6	20235	20240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_016821	TAG	2	6	20255	20260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016821	TGT	2	6	24107	24112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016821	CT	3	6	24115	24120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_016821	CCA	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_016821	AATA	2	8	24324	24331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016821	CACT	2	8	24357	24364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_016821	CAT	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_016821	AGA	2	6	24446	24451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016821	CAA	2	6	24501	24506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.